V souvislosti s vydáním nové betaverze iPhone OS 3.0 obdrželi vývojáři také upozornění, že veškeré nové aplikace, které budou poslány na schválení do App Store, musí být plně kompatibilní s tímto firmware. Apple upozornil, že starší aplikace musí být modifikovány, aby byli na novém software funkční, jinak budou z App Store vyřazeny!