Nakoniec som možno prišiel na čiastkové riešenie (píšem to, ak by to náhodou niekto googloval s rovnakým problémom).
Vytvoril som si Guest účet (nového usera) a v ňom mi export videa funguje zatiaľ správne. Po vyrenderovaní videa ho treba niekam skopírovať mimo Guest účtu, inak sa po odhlásení zmaže spolu s ostatnými súbormi hosťovského účtu.