Uživatelé iPhone 3GS v bílé barvě si stěžují na změnu barvy přístroje při častém používání. Na přístroji je vyditelná tmavá „skvrna“ uprostřed zadního krytu, který pravděpodobně vzniká díky přehřívání iPhone 3GS. Je možné, že přehříváním trpí i černý model, ovšem tam není změna barvy vidět. Obrázek zachycují změnu barvy si můžete prohlédnot zde.